1993年から製造された形式。有楽町線の増発・小竹向原〜新線池袋間の開業、西武線直通用に合計6編成が製造された。06系と同様のデザインとなっている。
2008年の副都心線開業に合わせて小竹向原駅にホームドアが導入されることになったが、ドア位置が異なるため対応できないため、5000系置き換え用として東西線へ転属している。当初は4本が、その後2本が転属している。なお、01編成は予備車確保のため一時的に千代田線で運行したことがある。
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